CRAN Package Check Results for Maintainer ‘Maria Victoria Diaz-Galian <mvdiazgalian at unex.es>’

Last updated on 2022-04-24 03:53:01 CEST.

Package	ERROR	OK
PhageCocktail	7	5

Package PhageCocktail

Current CRAN status: ERROR: 7, OK: 5

Version: 1.0.0
Check: examples
Result: ERROR
    Running examples in 'PhageCocktail-Ex.R' failed
    The error most likely occurred in:
    
    > base::assign(".ptime", proc.time(), pos = "CheckExEnv")
    > ### Name: PhageCocktail
    > ### Title: Design of the Best Phage Cocktail
    > ### Aliases: PhageCocktail
    >
    > ### ** Examples
    >
    > library(readxl)
    > x<-system.file("extdata","Sajben-Nagy.xlsx",package="PhageCocktail",mustWork=TRUE)
    >
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustiveSearch")
    New names:
    * `` -> `...1`
    * `` -> `...2`
    * `` -> `...3`
    * `` -> `...4`
    * `` -> `...5`
    * `` -> `...6`
    * `` -> `...7`
    * `` -> `...8`
    * `` -> `...9`
    * `` -> `...10`
    * `` -> `...11`
    * `` -> `...12`
    * `` -> `...13`
    * `` -> `...14`
    * `` -> `...15`
    * `` -> `...16`
    * `` -> `...17`
    $file
    [1] "/home/hornik/tmp/R.check/r-devel-clang/Work/build/Packages/PhageCocktail/extdata/Sajben-Nagy.xlsx"
    
    $method
    [1] "ExhaustiveSearch"
    
    $maxCocktailSize
    [1] "2"
    
    $allBacteriaLysed
    [1] "TRUE"
    
    $Result
    $Result$Size2
    [1] "Sajben-NagyP3" "Sajben-NagyP10" "18"
    
    $Result$Size1
    [1] "Sajben-NagyP3" "16"
    
    
    $BacteriaLysed
    $BacteriaLysed$Size2
     [1] "Sajben-NagyB1" "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4"
     [5] "Sajben-NagyB5" "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11"
     [9] "Sajben-NagyB13" "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB18"
    [13] "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23" "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30"
    [17] "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    $BacteriaLysed$Size1
     [1] "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4" "Sajben-NagyB5"
     [5] "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11" "Sajben-NagyB13"
     [9] "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23"
    [13] "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30" "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    
    $non_usefulPhages
    [1] "All the phages are useful (all of them lyse some bacterium)"
    
    $non_lysedBacteria
     [1] "Sajben-NagyB34" "Sajben-NagyB33" "Sajben-NagyB29" "Sajben-NagyB28"
     [5] "Sajben-NagyB27" "Sajben-NagyB26" "Sajben-NagyB25" "Sajben-NagyB22"
     [9] "Sajben-NagyB21" "Sajben-NagyB20" "Sajben-NagyB17" "Sajben-NagyB14"
    [13] "Sajben-NagyB12" "Sajben-NagyB9" "Sajben-NagyB8" "Sajben-NagyB7"
    
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustivePhi")
    New names:
    * `` -> `...1`
    * `` -> `...2`
    * `` -> `...3`
    * `` -> `...4`
    * `` -> `...5`
    * `` -> `...6`
    * `` -> `...7`
    * `` -> `...8`
    * `` -> `...9`
    * `` -> `...10`
    * `` -> `...11`
    * `` -> `...12`
    * `` -> `...13`
    * `` -> `...14`
    * `` -> `...15`
    * `` -> `...16`
    * `` -> `...17`
    Error in if (MaxPhage < Phi) { : argument is of length zero
    Calls: PhageCocktail -> ExhaustivePhi
    Execution halted
Flavor: r-devel-linux-x86_64-debian-clang

Version: 1.0.0
Check: examples
Result: ERROR
    Running examples in ‘PhageCocktail-Ex.R’ failed
    The error most likely occurred in:
    
    > base::assign(".ptime", proc.time(), pos = "CheckExEnv")
    > ### Name: PhageCocktail
    > ### Title: Design of the Best Phage Cocktail
    > ### Aliases: PhageCocktail
    >
    > ### ** Examples
    >
    > library(readxl)
    > x<-system.file("extdata","Sajben-Nagy.xlsx",package="PhageCocktail",mustWork=TRUE)
    >
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustiveSearch")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    $file
    [1] "/home/hornik/tmp/R.check/r-devel-gcc/Work/build/Packages/PhageCocktail/extdata/Sajben-Nagy.xlsx"
    
    $method
    [1] "ExhaustiveSearch"
    
    $maxCocktailSize
    [1] "2"
    
    $allBacteriaLysed
    [1] "TRUE"
    
    $Result
    $Result$Size2
    [1] "Sajben-NagyP3" "Sajben-NagyP10" "18"
    
    $Result$Size1
    [1] "Sajben-NagyP3" "16"
    
    
    $BacteriaLysed
    $BacteriaLysed$Size2
     [1] "Sajben-NagyB1" "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4"
     [5] "Sajben-NagyB5" "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11"
     [9] "Sajben-NagyB13" "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB18"
    [13] "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23" "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30"
    [17] "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    $BacteriaLysed$Size1
     [1] "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4" "Sajben-NagyB5"
     [5] "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11" "Sajben-NagyB13"
     [9] "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23"
    [13] "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30" "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    
    $non_usefulPhages
    [1] "All the phages are useful (all of them lyse some bacterium)"
    
    $non_lysedBacteria
     [1] "Sajben-NagyB34" "Sajben-NagyB33" "Sajben-NagyB29" "Sajben-NagyB28"
     [5] "Sajben-NagyB27" "Sajben-NagyB26" "Sajben-NagyB25" "Sajben-NagyB22"
     [9] "Sajben-NagyB21" "Sajben-NagyB20" "Sajben-NagyB17" "Sajben-NagyB14"
    [13] "Sajben-NagyB12" "Sajben-NagyB9" "Sajben-NagyB8" "Sajben-NagyB7"
    
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustivePhi")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    Error in if (MaxPhage < Phi) { : argument is of length zero
    Calls: PhageCocktail -> ExhaustivePhi
    Execution halted
Flavor: r-devel-linux-x86_64-debian-gcc

Version: 1.0.0
Check: examples
Result: ERROR
    Running examples in ‘PhageCocktail-Ex.R’ failed
    The error most likely occurred in:
    
    > ### Name: PhageCocktail
    > ### Title: Design of the Best Phage Cocktail
    > ### Aliases: PhageCocktail
    >
    > ### ** Examples
    >
    > library(readxl)
    > x<-system.file("extdata","Sajben-Nagy.xlsx",package="PhageCocktail",mustWork=TRUE)
    >
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustiveSearch")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    $file
    [1] "/data/gannet/ripley/R/packages/tests-clang/PhageCocktail.Rcheck/PhageCocktail/extdata/Sajben-Nagy.xlsx"
    
    $method
    [1] "ExhaustiveSearch"
    
    $maxCocktailSize
    [1] "2"
    
    $allBacteriaLysed
    [1] "TRUE"
    
    $Result
    $Result$Size2
    [1] "Sajben-NagyP3" "Sajben-NagyP10" "18"
    
    $Result$Size1
    [1] "Sajben-NagyP3" "16"
    
    
    $BacteriaLysed
    $BacteriaLysed$Size2
     [1] "Sajben-NagyB1" "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4"
     [5] "Sajben-NagyB5" "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11"
     [9] "Sajben-NagyB13" "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB18"
    [13] "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23" "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30"
    [17] "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    $BacteriaLysed$Size1
     [1] "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4" "Sajben-NagyB5"
     [5] "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11" "Sajben-NagyB13"
     [9] "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23"
    [13] "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30" "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    
    $non_usefulPhages
    [1] "All the phages are useful (all of them lyse some bacterium)"
    
    $non_lysedBacteria
     [1] "Sajben-NagyB34" "Sajben-NagyB33" "Sajben-NagyB29" "Sajben-NagyB28"
     [5] "Sajben-NagyB27" "Sajben-NagyB26" "Sajben-NagyB25" "Sajben-NagyB22"
     [9] "Sajben-NagyB21" "Sajben-NagyB20" "Sajben-NagyB17" "Sajben-NagyB14"
    [13] "Sajben-NagyB12" "Sajben-NagyB9" "Sajben-NagyB8" "Sajben-NagyB7"
    
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustivePhi")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    Error in if (MaxPhage < Phi) { : argument is of length zero
    Calls: PhageCocktail -> ExhaustivePhi
    Execution halted
Flavor: r-devel-linux-x86_64-fedora-clang

Version: 1.0.0
Check: examples
Result: ERROR
    Running examples in ‘PhageCocktail-Ex.R’ failed
    The error most likely occurred in:
    
    > ### Name: PhageCocktail
    > ### Title: Design of the Best Phage Cocktail
    > ### Aliases: PhageCocktail
    >
    > ### ** Examples
    >
    > library(readxl)
    > x<-system.file("extdata","Sajben-Nagy.xlsx",package="PhageCocktail",mustWork=TRUE)
    >
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustiveSearch")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    $file
    [1] "/data/gannet/ripley/R/packages/tests-devel/PhageCocktail.Rcheck/PhageCocktail/extdata/Sajben-Nagy.xlsx"
    
    $method
    [1] "ExhaustiveSearch"
    
    $maxCocktailSize
    [1] "2"
    
    $allBacteriaLysed
    [1] "TRUE"
    
    $Result
    $Result$Size2
    [1] "Sajben-NagyP3" "Sajben-NagyP10" "18"
    
    $Result$Size1
    [1] "Sajben-NagyP3" "16"
    
    
    $BacteriaLysed
    $BacteriaLysed$Size2
     [1] "Sajben-NagyB1" "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4"
     [5] "Sajben-NagyB5" "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11"
     [9] "Sajben-NagyB13" "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB18"
    [13] "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23" "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30"
    [17] "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    $BacteriaLysed$Size1
     [1] "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4" "Sajben-NagyB5"
     [5] "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11" "Sajben-NagyB13"
     [9] "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23"
    [13] "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30" "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    
    $non_usefulPhages
    [1] "All the phages are useful (all of them lyse some bacterium)"
    
    $non_lysedBacteria
     [1] "Sajben-NagyB34" "Sajben-NagyB33" "Sajben-NagyB29" "Sajben-NagyB28"
     [5] "Sajben-NagyB27" "Sajben-NagyB26" "Sajben-NagyB25" "Sajben-NagyB22"
     [9] "Sajben-NagyB21" "Sajben-NagyB20" "Sajben-NagyB17" "Sajben-NagyB14"
    [13] "Sajben-NagyB12" "Sajben-NagyB9" "Sajben-NagyB8" "Sajben-NagyB7"
    
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustivePhi")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    Error in if (MaxPhage < Phi) { : argument is of length zero
    Calls: PhageCocktail -> ExhaustivePhi
    Execution halted
Flavor: r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc

Version: 1.0.0
Check: examples
Result: ERROR
    Running examples in ‘PhageCocktail-Ex.R’ failed
    The error most likely occurred in:
    
    > base::assign(".ptime", proc.time(), pos = "CheckExEnv")
    > ### Name: PhageCocktail
    > ### Title: Design of the Best Phage Cocktail
    > ### Aliases: PhageCocktail
    >
    > ### ** Examples
    >
    > library(readxl)
    > x<-system.file("extdata","Sajben-Nagy.xlsx",package="PhageCocktail",mustWork=TRUE)
    >
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustiveSearch")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    $file
    [1] "/home/hornik/tmp/R.check/r-patched-gcc/Work/build/Packages/PhageCocktail/extdata/Sajben-Nagy.xlsx"
    
    $method
    [1] "ExhaustiveSearch"
    
    $maxCocktailSize
    [1] "2"
    
    $allBacteriaLysed
    [1] "TRUE"
    
    $Result
    $Result$Size2
    [1] "Sajben-NagyP3" "Sajben-NagyP10" "18"
    
    $Result$Size1
    [1] "Sajben-NagyP3" "16"
    
    
    $BacteriaLysed
    $BacteriaLysed$Size2
     [1] "Sajben-NagyB1" "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4"
     [5] "Sajben-NagyB5" "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11"
     [9] "Sajben-NagyB13" "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB18"
    [13] "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23" "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30"
    [17] "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    $BacteriaLysed$Size1
     [1] "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4" "Sajben-NagyB5"
     [5] "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11" "Sajben-NagyB13"
     [9] "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23"
    [13] "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30" "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    
    $non_usefulPhages
    [1] "All the phages are useful (all of them lyse some bacterium)"
    
    $non_lysedBacteria
     [1] "Sajben-NagyB34" "Sajben-NagyB33" "Sajben-NagyB29" "Sajben-NagyB28"
     [5] "Sajben-NagyB27" "Sajben-NagyB26" "Sajben-NagyB25" "Sajben-NagyB22"
     [9] "Sajben-NagyB21" "Sajben-NagyB20" "Sajben-NagyB17" "Sajben-NagyB14"
    [13] "Sajben-NagyB12" "Sajben-NagyB9" "Sajben-NagyB8" "Sajben-NagyB7"
    
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustivePhi")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    Error in if (MaxPhage < Phi) { : argument is of length zero
    Calls: PhageCocktail -> ExhaustivePhi
    Execution halted
Flavor: r-patched-linux-x86_64

Version: 1.0.0
Check: examples
Result: ERROR
    Running examples in ‘PhageCocktail-Ex.R’ failed
    The error most likely occurred in:
    
    > base::assign(".ptime", proc.time(), pos = "CheckExEnv")
    > ### Name: PhageCocktail
    > ### Title: Design of the Best Phage Cocktail
    > ### Aliases: PhageCocktail
    >
    > ### ** Examples
    >
    > library(readxl)
    > x<-system.file("extdata","Sajben-Nagy.xlsx",package="PhageCocktail",mustWork=TRUE)
    >
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustiveSearch")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    $file
    [1] "/home/hornik/tmp/R.check/r-release-gcc/Work/build/Packages/PhageCocktail/extdata/Sajben-Nagy.xlsx"
    
    $method
    [1] "ExhaustiveSearch"
    
    $maxCocktailSize
    [1] "2"
    
    $allBacteriaLysed
    [1] "TRUE"
    
    $Result
    $Result$Size2
    [1] "Sajben-NagyP3" "Sajben-NagyP10" "18"
    
    $Result$Size1
    [1] "Sajben-NagyP3" "16"
    
    
    $BacteriaLysed
    $BacteriaLysed$Size2
     [1] "Sajben-NagyB1" "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4"
     [5] "Sajben-NagyB5" "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11"
     [9] "Sajben-NagyB13" "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB18"
    [13] "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23" "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30"
    [17] "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    $BacteriaLysed$Size1
     [1] "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4" "Sajben-NagyB5"
     [5] "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11" "Sajben-NagyB13"
     [9] "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23"
    [13] "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30" "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    
    $non_usefulPhages
    [1] "All the phages are useful (all of them lyse some bacterium)"
    
    $non_lysedBacteria
     [1] "Sajben-NagyB34" "Sajben-NagyB33" "Sajben-NagyB29" "Sajben-NagyB28"
     [5] "Sajben-NagyB27" "Sajben-NagyB26" "Sajben-NagyB25" "Sajben-NagyB22"
     [9] "Sajben-NagyB21" "Sajben-NagyB20" "Sajben-NagyB17" "Sajben-NagyB14"
    [13] "Sajben-NagyB12" "Sajben-NagyB9" "Sajben-NagyB8" "Sajben-NagyB7"
    
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustivePhi")
    New names:
    • `` -> `...1`
    • `` -> `...2`
    • `` -> `...3`
    • `` -> `...4`
    • `` -> `...5`
    • `` -> `...6`
    • `` -> `...7`
    • `` -> `...8`
    • `` -> `...9`
    • `` -> `...10`
    • `` -> `...11`
    • `` -> `...12`
    • `` -> `...13`
    • `` -> `...14`
    • `` -> `...15`
    • `` -> `...16`
    • `` -> `...17`
    Error in if (MaxPhage < Phi) { : argument is of length zero
    Calls: PhageCocktail -> ExhaustivePhi
    Execution halted
Flavor: r-release-linux-x86_64

Version: 1.0.0
Check: examples
Result: ERROR
    Running examples in 'PhageCocktail-Ex.R' failed
    The error most likely occurred in:
    
    > ### Name: PhageCocktail
    > ### Title: Design of the Best Phage Cocktail
    > ### Aliases: PhageCocktail
    >
    > ### ** Examples
    >
    > library(readxl)
    > x<-system.file("extdata","Sajben-Nagy.xlsx",package="PhageCocktail",mustWork=TRUE)
    >
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustiveSearch")
    New names:
    * `` -> `...1`
    * `` -> `...2`
    * `` -> `...3`
    * `` -> `...4`
    * `` -> `...5`
    * `` -> `...6`
    * `` -> `...7`
    * `` -> `...8`
    * `` -> `...9`
    * `` -> `...10`
    * `` -> `...11`
    * `` -> `...12`
    * `` -> `...13`
    * `` -> `...14`
    * `` -> `...15`
    * `` -> `...16`
    * `` -> `...17`
    $file
    [1] "D:/temp/RtmpIJdUkj/RLIBS_89b829dec1c/PhageCocktail/extdata/Sajben-Nagy.xlsx"
    
    $method
    [1] "ExhaustiveSearch"
    
    $maxCocktailSize
    [1] "2"
    
    $allBacteriaLysed
    [1] "TRUE"
    
    $Result
    $Result$Size2
    [1] "Sajben-NagyP3" "Sajben-NagyP10" "18"
    
    $Result$Size1
    [1] "Sajben-NagyP3" "16"
    
    
    $BacteriaLysed
    $BacteriaLysed$Size2
     [1] "Sajben-NagyB1" "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4"
     [5] "Sajben-NagyB5" "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11"
     [9] "Sajben-NagyB13" "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB18"
    [13] "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23" "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30"
    [17] "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    $BacteriaLysed$Size1
     [1] "Sajben-NagyB2" "Sajben-NagyB3" "Sajben-NagyB4" "Sajben-NagyB5"
     [5] "Sajben-NagyB6" "Sajben-NagyB10" "Sajben-NagyB11" "Sajben-NagyB13"
     [9] "Sajben-NagyB15" "Sajben-NagyB16" "Sajben-NagyB19" "Sajben-NagyB23"
    [13] "Sajben-NagyB24" "Sajben-NagyB30" "Sajben-NagyB31" "Sajben-NagyB32"
    
    
    $non_usefulPhages
    [1] "All the phages are useful (all of them lyse some bacterium)"
    
    $non_lysedBacteria
     [1] "Sajben-NagyB34" "Sajben-NagyB33" "Sajben-NagyB29" "Sajben-NagyB28"
     [5] "Sajben-NagyB27" "Sajben-NagyB26" "Sajben-NagyB25" "Sajben-NagyB22"
     [9] "Sajben-NagyB21" "Sajben-NagyB20" "Sajben-NagyB17" "Sajben-NagyB14"
    [13] "Sajben-NagyB12" "Sajben-NagyB9" "Sajben-NagyB8" "Sajben-NagyB7"
    
    >
    > PhageCocktail(x,"ExhaustivePhi")
    New names:
    * `` -> `...1`
    * `` -> `...2`
    * `` -> `...3`
    * `` -> `...4`
    * `` -> `...5`
    * `` -> `...6`
    * `` -> `...7`
    * `` -> `...8`
    * `` -> `...9`
    * `` -> `...10`
    * `` -> `...11`
    * `` -> `...12`
    * `` -> `...13`
    * `` -> `...14`
    * `` -> `...15`
    * `` -> `...16`
    * `` -> `...17`
    Error in if (MaxPhage < Phi) { : argument is of length zero
    Calls: PhageCocktail -> ExhaustivePhi
    Execution halted
Flavor: r-oldrel-windows-ix86+x86_64